Көкшетау таулары батысқа қарай дөңес, ұзындығы 35 шақырым шағын таулы жер құрайды. Оңтүстік қанаты Щучинск қаласына жақын, солтүстігі - Бөлектау тауымен аяқталатын Айнакөл көліне тіреледі. Жотасы оңтүстік пен солтүстіктен тұрады, олар орта бөлігінде рельефке тән төмендеумен - Ақылбай асуымен. Көкше шыңының ең жоғарғы нүктесі-солтүстік жотада орналасқан. Ол теңіз деңгейінен 947 метр. Айнакөл көлінің салыстырмалы биіктігі-640 метр. Көкше шыңы жартасты, мұнда тастардың кесектері бар.

Көкше шыңынан Бурабайдың тамаша көрінісі ашылады. Көкшетау тауының баурайлары симметриялы емес. Батыс, шығыс таулары-ормандармен жабылған, тік таулар ауданның қолайлы микроклиматын жасайды. Абылай хан алаңынан Көкшенің төбесін ашық күн сәулесіне жақсы қарауға болады. Таудың шыңдары бойынша үнемі таза азондалған ауамен бұлттар шегеді, олар көгілдір әсерін жасайды.

Көкшенің ең жоғарғы жағында "кеме", төменгі жағында "чертово катушка" бейнесі анық көрінеді. Ұзындығы 60 метр, ені 25 метр тегіс жол. Бұл құбылыстың геологиялық түсініктемесі найзағай кезінде сырғанау жазықтығы бойынша жартастың үлкен бөлігі үзіліп, төмен қарай құлады. Көкшенің оң жағында "үш апа" шоқысының үш шыңы көрінеді.

Жазушы Жанайдар Мусин өзінің "Жер шоқтығы Көкшетау" атты кітабында қарауыл руынан шыққан үш апа-сіңлілері туралы аңыз келтіреді. Көкшенің бірінші тауы-үлкен апасы, екінші тау-орта апасы және үшінші тау-ағасы Оқжетпестің қасында кіші апа-деп сыйпатаған.