Курорттың өсімдігі Көкшетау биіктігінің ландшафтық ерекшеліктерімен тығыз байланысты. Оның жағдайы мен қиылысуы, қоршаған аумақтармен салыстырғанда жауын-шашын мөлшері біршама көп, ылғалмен қамтамасыз етілуі дала аймағындағы орман-дала ландшафтының болуын анықтайды.

Гранит алқаптарының жоғарғы бөлігінде қарағай және қайың-қарағай ормандары басым. Төменгі бөлігінде орман-дала үйлесімі тән. Бурабай курорттық аймағының өсімдіктері келесі түрлерден тұрады: орман, дала, шалғын, батпақты және сортаң (шөлді).

Орман қоғамдастықтары. Қазіргі уақытта курорттық аймақтың ормандары жеті орманшылыққа бөлінген: Бурабай, Мирное, Золотобор, Таулы, Ақылбай, Қотыркөл және Приозерное. Жалпы ауданы 65 000 га. Айталған дала 44,8% ішінен 43,5% орманнан тұрады. Қалған ауданы көлдермен қамтылған. Ағаш тұқымдарынан бірінші орыны қарағай, ал екінші - қайың. Көктер қарағай мен қайың қоспасы ретінде кездеседі. Гранит тау бөктерінде таза қарағайлар қалыптасады, кварцит-сланецті тау бөктерінде және тау бөктерінде қайың едәуір үлесі бар қарағайлар дамиды. Таулы жазықтарында (төмен, жазық үйінділер) қрағайлы және қайың ормандары бар. Мұнда қарағай позициясы тұрақсыз, ол жиі жапырақты тұқымдармен ауыстырылады. Гранитті тау бөктері қарағайлар бірнеше түрге бөлінеді.

Қарағай өте құрғақ тасты-жартасты, әдетте ең биік гранит увалдарының жоталарында, шоқылар мен жоталарда, баурайлардың жоғарғы бөліктерінде кездеседі. Ылғалдандыру тек атмосфералық жауын-шашын есебінен жүргізіледі. Жер бетінің көп бөлігі ірі гранит қабаттарының, жартасты тастардың шығуларынан тұрады. Топырақ тек граниттегі жарықтар мен шағын тереңдіктерде қалыптасады, онда желденгенде түзілетін жыныстар бөлшектері жуылады.

Ағаш өсімдіктері ылғалдың созылмалы жетіспеушілігін бастан кешіреді. Екпелер желдің күшті әсеріне ұшырайды, сондықтан ағаштар жиі бір ұшарбалары мен қатты иілген діңдері болады. Көбінесе топырақпен жабылмаған ірі тамырлар гранит бетінде жарықтардың үстінен тарылады. Жарықтарға енгізіліп, диаметрдің өсуіне қарай ұлғайып, қаңқалы тамырларды кейде жинап, граниттің ірі кесектерін көтереді. 90-95 жастағы қарағай биіктігі 8-10 метр, орташа диаметрі 12-16 см. осы тұқымдас екпелердің эстетикалық және жоғары топырақ қорғанысының маңызы бар.

Құрғақ тасты қарағай. Орманның осы түрінің екпелері әдетте қиғаш және көмкерілген, жақсы жарықтандырылған беткейлер, тегістелген, аз қуатты элювиальды-делювиалды шөгінділермен көмкерілген шыңдарды алып жатыр. Атмосфералық жауын-шашын мен беттік ағынның шамалы шоғырлануы есебінен ылғалдандырылады. Бұл ағаштар ылғалдың мезгілдік жетіспеушілігін сезінеді. Тұйық екпелер үшін орман төсенішінің қалың қабаты тән. Оның қуаты 3-5 см, кей жерлерде батыста 10-15 см жетеді. Төсеніш негізінен түскен қылқан жапырақты және ұсақ қарағай бұтақтарынан тұрады. 70 жастағы қарағайдың орташа биіктігі 13-14 метр, орташа диаметрі 14-16 см.

Жаңа тасты қарағай. Гранит жоталарының ірі баурайларында (Көкше тауының солтүстік баурайы) таралған. Гранит қабықтары мен монолиттерінің бетіне шығу топырақтық-экологиялық жағдай тудырмайды. Ылғалдану атмосфералық жауын-шашын, конденсация және беттік ағынның ішінара шоғырлануы есебінен жүреді. Неғұрлым жұмсақ жылу режимі, ауаның үлкен салыстырмалы ылғалдылығы, күннің көп бөлігінің көлеңкеленуі салдарынан аз физикалық булану тік солтүстік беткейлерде қарағай үшін неғұрлым қолайлы экологиялық жағдайлар жасайды. Топырағы қоңыр, оранды, құмайты.

80 жастағы қарағай, орташа биіктігі 11-12 метр, орташа диаметрі 12 см. Екпелердің үлкен топырақ қорғанышы және ылғал реттеуші маңызы бар. Орман өнеркәсібі мәні төмен.

Жаңа өскен қарағайлар. Көл террасаларына, көлге жанасатын баурайлардың өте төменгі бөліктерінде кездеседі. Атмосфералық жауын-шашынның, жер бетіндегі ағындардың шоғырлануының және жер асты суларының бетіне сыналуының есебінен жеткілікті ылғалдандыру. Топырағы шым буроземалы, жеңілкөмірлі. Қарағайдан жасалған ағаш сақалды қайың қоспасы бар. 70 жастағы қарағайдың орташа биіктігі 15-16 метр, орташа диаметрі 16 см. Бұл тип үлкен ылғал реттеу және орман өнеркәсібінде маңызды.

Қайың сулы қарағай, құрақ-қамыс. Әдетте ежелгі және заманауи алқаптардың төмен батпақты террасаларында қалыптасады. Ылғалдану әлсіз, үнемі артық. Топырақ шымтезек-батпақты. Бөшкелер арасында құламалар жиналады. Төсеніштің қуаты 10-15 см дейін. Көктемде қар мен жаңбыр ергеннен кейін бөшкелер арасындағы кеңістік сумен толтырылады. Кейін судың біртіндеп ағып кетуі және булануы жүреді. Таза және қайыңмен аралас екпелер. Мүк жамылғысы өте жақсы дамыған. Қарағайдың табиғи жаңаруы қанағаттанарлық. Орман өнеркәсібінде маңызы жоқ.

Қайың және қайың формация тобы. Гранит тау бөктеріндегі қайың екпелері, әдетте, туынды болып табылады. Ағаштың негізі сақалды қайың, бірақ қарағай қоспасы бар. Қайың тұрақсыз, бір-екі ұрпақ бойы қарағайлы болады. Жер үсті жамылғысы гранит тауының сипатталған қарағайларының топырақ жамылғысынан мүлдем өзгеше емес. Тек жабық ағынсыз ылғалдануы бар төмендеулерде ғана тамыр қайыңдары қалыптасады.

Сулы қамысты қайын. Тұрақты артық-салынған ылғалдылығы бар тұйық ағынсыз төмендеулерге негізделген. Топырағы шымтезек-батпақты граниттерде немесе шалғындық-батпақты, кварц-тақтасты. Қайың мен қарағай қосындысы бар қабығынан сүректес. 30 жастағы қайыңның орташа биіктігі 10-11 метр, орташа диаметрі 22 см.

Әулиекөл көлінің солтүстік жағасында, Күркіреу өзенінің бастауында желден, оқпандардан жанасқан "Би қайың" тоғайы бар.

Орманның ерекше түрі-қарағай, көктерек, қайың өсетін орман батпағы. Көктерек қарағай мен қайыңға қоспасы тек Қотыркөл ауданында кездеседі, 78 га таза көктерек ормандары бар. Бұталардан: сары акация, итмұрын, ива, кәдімгі кизильник, татар ырғай, сібір доланасы, қызыл және қара қарақат, дала шиесі, аршаның екі түрі кездеседі. Жазғы уақытта орманда таңқурай, құлпынай, сүйектер, бөренелер пайда болады, көптеген саңырауқұлақтар болады.

Шалғынды-дала өсімдіктері. Шабындықтарда, өзеннің құйылатын жерлерінде, қазан көлдерінде, шалғынды немесе сортаң қара топырақты ормандар мен бұталар арасында таралған. Шөптер - дала түрлері, орман және шабындық өсімдіктер. Отырса, тырса, қылтанақсыз арпабас, жолжелкен және көптеген басқа да шөптер түрлері өседі.